Kepadatan penduduk yang mendadak di area pengungsian sering kali memicu permasalahan limbah yang jika tidak dikelola dengan baik akan menjadi sumber wabah penyakit yang mematikan. Melaksanakan manajemen sanitasi lingkungan yang baik adalah tugas berat bagi relawan yang melibatkan perencanaan tata letak jamban darurat, pengelolaan sampah, hingga drainase air limbah rumah tangga. Fokus utamanya adalah memutus rantai penularan penyakit berbasis lingkungan dengan memastikan bahwa setiap individu memiliki akses terhadap sarana kebersihan yang memadai. Ketegasan dalam menerapkan aturan kebersihan kolektif di area kamp sangat diperlukan agar kualitas hidup para pengungsi tetap terjaga meskipun dalam kondisi yang serba terbatas dan memprihatinkan.
Pembangunan jamban keluarga atau komunal harus memperhatikan jarak aman dari sumber air minum, yakni minimal sepuluh hingga lima belas meter untuk mencegah infiltrasi bakteri E. coli. Dalam menjalankan manajemen sanitasi lingkungan, pemilihan teknologi jamban harus disesuaikan dengan kondisi tanah; jika tanah berbatu atau berair tinggi, penggunaan jamban atas tanah dengan sistem bak penampung tertutup lebih disarankan. Relawan juga bertugas memastikan ketersediaan sabun dan air mengalir di setiap bilik jamban guna mendorong kebiasaan cuci tangan pakai sabun (CTPS) di kalangan warga. Kebersihan sarana sanitasi ini harus dipantau setiap hari oleh kader kesehatan dari kalangan pengungsi itu sendiri untuk menumbuhkan rasa memiliki dan tanggung jawab bersama.
Selain urusan limbah manusia, pengelolaan sampah padat juga menjadi pilar penting dalam kesehatan lingkungan. Melalui manajemen sanitasi lingkungan yang sistematis, relawan harus memfasilitasi pembuatan lubang sampah organik dan anorganik yang terpisah agar tidak mengundang lalat, kecoa, atau tikus sebagai vektor penyakit. Pembakaran sampah secara terbuka sangat tidak dianjurkan karena asapnya dapat mengganggu kesehatan pernapasan para pengungsi yang tinggal di tenda-tenda dengan ventilasi terbatas. Solusi pengolahan sampah mandiri seperti pengomposan sederhana untuk sisa makanan dari dapur umum dapat mengurangi volume tumpukan sampah sekaligus memberikan manfaat bagi kesuburan tanah di sekitar lokasi pengungsian dalam jangka panjang.
Keberhasilan dari program kesehatan lingkungan ini sangat bergantung pada tingkat partisipasi masyarakat yang tinggal di dalam kamp. Edukasi mengenai manajemen sanitasi lingkungan tidak boleh berhenti pada penyediaan alat, melainkan harus menyentuh perubahan perilaku secara masif. Relawan PMI harus melakukan sosialisasi yang kreatif, misalnya melalui lomba kebersihan antar blok tenda atau penyuluhan kesehatan menggunakan media visual yang mudah dipahami. Dengan lingkungan yang bersih dan tertata rapi, risiko terjadinya kejadian luar biasa (KLB) penyakit dapat dihindari, dan para pengungsi dapat beristirahat dengan lebih nyaman, sehingga proses pemulihan fisik dan mental mereka berjalan lebih optimal tanpa gangguan kesehatan tambahan yang tidak perlu.